L'interno della chiesa, ad unica navata, è in stile barocco. L'altare maggiore, settecentesco, è realizzato con marmi policromi ed è delimitato ai lati da due angeli reggicandelabro. E' sormontato da una cornice modanata, che racchiude la pala dell'altare e si conclude con un ovale raffigurante l'immagine della Vergine. La pala dell'altare è opera di Michele Ricciardi, datata 1724.La composizione, ricca di movimento e di pathos, si rifà ad una credenza romana, riportata da Jacopo da Voragine nella sua Legenda Aurea. Si riteneva che S.Pietro, dopo insistenze dei cristiani, per sfuggire alle persecuzioni, avesse lasciato Roma. Dopo aver incontrato Cristo, sulla Via Appia, era tornato a Roma dove l'attendeva la crocifissione. Il dipinto raffigura Cristo e ai suoi piedi Pietro, alle spalle di questi si intravede Roma, e dall'alto una schiera di angeli reca la croce, la palma del martirio, la chiavi e la mitria papale simboli del martirio e della gloria del Santo. Domina la pala l'ovale raffigurante la Vergine con Figlio anch'essa settecentesca.